Лилейник Миддендорфа - раннего срока цветения. Корневище толстое, листья линейные, шириной около 2 см. По мере роста они обвисают, открывая тонкие прямые цветоносы. Высота куста около 50 см, цветоносов 80 см. На верхушке каждого расположено соцветие с несколькими бутонами. Каждый цветок раскрыт не больше дня, редко – два дня. Поэтому продолжительность цветения обеспечивается большим количеством бутонов. Цветки открываются утром, а вечером закрываются. Иногда растение зацветает повторно, в августе. На месте цветка формируется плод – коробочка с тремя гранями. Семена черного цвета, блестящие, созревают в июле. Цветок обычный для растений лилейников, простой, с шестираздельным венчиком. Диаметр его в раскрытом виде около 11 см, длина 9 см. Обладает резким, но не очень приятным запахом.